Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms