Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms