Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms