Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DZIP3Q86Y13 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DZIP3Q86Y13 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms