Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms