Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms