Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms