Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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