Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00173Q6ZV60 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00173Q6ZV60 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms