Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO4C1Q6ZQN7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO4C1Q6ZQN7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms