Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms