Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms