Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms