Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD4Q6IC98 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms