Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102BQ68D86 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms