Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms