Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms