Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms