Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT2Q5VUG0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT2Q5VUG0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms