Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms