Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERM1Q5SV97 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms