Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms