Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms