Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDCA8Q53HL2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms