Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC184Q52MB2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms