Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF1Q3BBV0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms