Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q1T7F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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