Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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