Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL23Q16540 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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