Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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