Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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