Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms