Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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CNN3Q15417 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CNN3Q15417 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CNN3Q15417 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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