Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RRS1Q15050 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms