Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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