Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms