Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms