Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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