Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NWD1Q149M9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NWD1Q149M9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NWD1Q149M9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NWD1Q149M9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NWD1Q149M9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NWD1Q149M9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
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