Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD11Q14690 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms