Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCNIQ14094 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms