Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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