Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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