Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TMED1Q13445 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TMED1Q13445 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TMED1Q13445 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TMED1Q13445 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TMED1Q13445 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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