Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
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