Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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