Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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