Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms