Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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LMAN2Q12907 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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