Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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